De geschiedenis van Kindcentrum Eigen-wijs begint met twee locaties: de Margrietschool en De Bron.

In 1929 werd de Margrietschool opgericht aan de Westelijke Parallelweg. In 1957 veranderde de naam van de lagere school in Da Costaschool en de kleuterschool kreeg de naam Prinses Margrietschool. In 1983 gingen beide scholen verder onder één naam: de Margrietschool. In 1989 trok de kleuterschool in bij de Margrietschool aan de H. Lipperheystraat.

In 1952 startte het Hervormd Centrum Meerdervoort, een kleuterschool opgericht door de Vereniging voor Christelijk Volksonderwijs. In 1955 werd de naam veranderd in Prinses Marijkeschool. Deze school ging in 1985 op in basisschool De Bron.

De Bron zelf begon eerder, in 1965, in een zaaltje van de kerk. Op 1 augustus 1965 werd het nieuwe schoolgebouw aan de Uilenvliet betrokken. De kleuterschool stond toen nog los van het hoofdgebouw, maar werd in augustus 2000 toegevoegd aan het bestaande gebouw.

In 1985, door een wetswijziging die de integratie van kleuter- en lager onderwijs mogelijk maakte, ontstonden nieuwe basisscholen: de Margrietschool door het samengaan van kleuterschool Prinses Margriet en lagere school Da Costa, en De Bron door de fusie van kleuterscholen Rehoboth en Uilennest met de lagere school De Bron.

In 2009 breidde de Margrietschool haar aanbod uit met de start van peuterspeelgroep Margrietje.

In 2015 fuseerden Stichting Kinderopvang Zwijndrecht (SKZ) en PCOAZ tot PIT kinderopvang & onderwijs, waardoor ook de Margrietschool en De Bron onderdeel werden van deze integrale organisatie.

In 2025 zullen kindcentrum Margriet en kindcentrum De Bron fuseren tot één nieuw integraal kindcentrum: Eigen-wijs, voor kinderen van 0 tot 13 jaar, op de locatie van De Bron aan de Uilenvliet.